前海湾保税港区自2009年8月封关运作以来，蛇口海关始终致力于优化通关环境，提高运作效能为导向，积极为实现企业高效运作和严密监管的有机结合，优化创新监管模式，搭建区内企业仓储信息平台，不断提升通关效率。
蛇口海关从招商保税“两仓”业务到保税港区业务监管模式下，管理到闸口，面临着硬件设施不足、信息系统不完善等诸多因素，海关为最大程度提升港区通关效率，持续推进各项创新举措。三年多来，先后推动实现电子围网封关，实行分类通关；完成“跨关区”调拨解决方案，实现保税港区与西部各码头的一体化运作；推动实施“入区即卸货”模式，并实现查验场所多元化；利用GPS等信息技术打通园区至香港的跨境快速通关通道；启用“分送集报”模式，打造进口分拨中心，推进“港仓”内移等等，有效提升了保税港区货物进出通关效率。同时，海关在人手紧张的情况下实行7天工作制及8小时以外预约式加班服务制度，最大限度满足区内不同企业的个性化通关需求。在国际贸易、商业交接和国际物流单证逐步趋向统一标准和电子化的背景下，为推动保税港区通关业务发展，不断提高海关监管效率，进一步压缩低风险货物的通关环节和贸易成本。今年年初，在蛇口海关的大力支持下，前海湾保税港区再增通关利器，率先在全国保税港区内实施“无纸化”通关作业。
“无纸化”通关作业，招商保税可以直接向蛇口海关发送报关单电子数据，无需到海关递交纸质单证，整个过程只用电脑操作，全部通关手续只需点点鼠标几分钟就能完成。若被海关系统核定为低风险报关单，货物还会由H2000系统自动完成所有操作，减少多个作业环节，提高通关效率约30%。同时，可实现24小时通关，大大节省了往返海关现场递交纸质单证的人力和时间成本。自“无纸化”通关作业以来，一线进出境报关票数占一线单量98.24%；二线进出区报关票数占二线单量83.97%。按照招商保税2012年度18万票单证的处理量计算，如果全面实施“无纸化”通关，年节约纸张和碳粉经费20余万元。
随着前海发展规划定位，结合保税港区的政策功能，招商保税与蛇口海关正积极加强调查研究各种创新通关措施，加快新客户群拓展，提高供港货物配送效率，为下一步跨境贸易电子商务业务打下坚实基础。推动探索保税港区转型升级，全面提升物流业一体化服务水平，在前海湾共同打造全球供应链管理中心及国际产品交易中心，向更高端物流业和现代服务业发展，努力将前海湾保税港区打造成为深港现代服务业合作区的典范。
【无纸化通关作业】是指海关以企业分类管理和风险分析为基础，按照风险等级对进出口货物实施分类，运用信息化技术改变海关验核进出口企业递交纸质报关单及随附单证办理通关手续的做法，直接对企业通过中国电子口岸录入申报的报关单及随附单证的电子数据进行无纸审核、验放处理的通关作业方式。
